Protein–RNA interactions for Protein: O35544

Slc1a6, Excitatory amino acid transporter 4, mousemouse

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Length 561 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a6O35544 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc1a6O35544 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc1a6O35544 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc1a6O35544 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc1a6O35544 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc1a6O35544 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc1a6O35544 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc1a6O35544 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc1a6O35544 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc1a6O35544 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc1a6O35544 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc1a6O35544 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc1a6O35544 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc1a6O35544 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc1a6O35544 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc1a6O35544 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc1a6O35544 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc1a6O35544 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc1a6O35544 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc1a6O35544 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc1a6O35544 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc1a6O35544 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc1a6O35544 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc1a6O35544 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc1a6O35544 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc1a6O35544 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc1a6O35544 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc1a6O35544 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc1a6O35544 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc1a6O35544 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc1a6O35544 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc1a6O35544 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc1a6O35544 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc1a6O35544 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc1a6O35544 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc1a6O35544 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc1a6O35544 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc1a6O35544 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc1a6O35544 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc1a6O35544 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc1a6O35544 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc1a6O35544 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc1a6O35544 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc1a6O35544 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc1a6O35544 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc1a6O35544 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc1a6O35544 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc1a6O35544 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc1a6O35544 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc1a6O35544 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc1a6O35544 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc1a6O35544 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc1a6O35544 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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