Protein–RNA interactions for Protein: O35452

Tnxb, Tenascin X, mousemouse

Predictions only

Length 4,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnxbO35452 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
TnxbO35452 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Rrm2b-207ENSMUST00000146821 420 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
TnxbO35452 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Gm11942-201ENSMUST00000180255 345 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
TnxbO35452 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
TnxbO35452 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Rps18-201ENSMUST00000008812 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
TnxbO35452 4933428M09Rik-201ENSMUST00000113046 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Gm15506-201ENSMUST00000148776 1133 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
TnxbO35452 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Gm17796-201ENSMUST00000189015 1213 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
TnxbO35452 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
TnxbO35452 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Sec13-201ENSMUST00000032440 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
TnxbO35452 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Gm20831-201ENSMUST00000177639 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Ssty1-202ENSMUST00000186035 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Gm20737-202ENSMUST00000187245 1338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Gm20777-202ENSMUST00000187434 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Gm20873-202ENSMUST00000187857 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Gm20772-201ENSMUST00000188928 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Gm21310-202ENSMUST00000189630 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Gm20795-202ENSMUST00000190909 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Gm21454-202ENSMUST00000192204 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Gm21440-201ENSMUST00000192749 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Gm20831-202ENSMUST00000194411 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Gm20807-201ENSMUST00000194687 1336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Gm21425-202ENSMUST00000195626 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Lonp2-207ENSMUST00000163987 1556 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
TnxbO35452 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
TnxbO35452 0610037L13Rik-206ENSMUST00000120473 835 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Gm43854-201ENSMUST00000200418 394 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
TnxbO35452 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
TnxbO35452 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms