Protein–RNA interactions for Protein: O35405

Pld3, Phospholipase D3, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pld3O35405 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pld3O35405 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pld3O35405 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pld3O35405 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pld3O35405 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pld3O35405 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pld3O35405 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pld3O35405 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pld3O35405 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pld3O35405 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pld3O35405 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pld3O35405 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pld3O35405 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pld3O35405 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pld3O35405 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pld3O35405 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pld3O35405 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pld3O35405 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.3 ms