Protein–RNA interactions for Protein: O35228

Ebi3, Interleukin-27 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebi3O35228 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms