Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Kcns1O35173 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Kcns1O35173 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Kcns1O35173 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Kcns1O35173 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Kcns1O35173 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Kcns1O35173 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Kcns1O35173 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Kcns1O35173 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Kcns1O35173 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Kcns1O35173 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Kcns1O35173 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Kcns1O35173 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Kcns1O35173 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Kcns1O35173 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Kcns1O35173 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Kcns1O35173 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Kcns1O35173 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Kcns1O35173 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Kcns1O35173 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Kcns1O35173 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Kcns1O35173 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Kcns1O35173 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Kcns1O35173 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Kcns1O35173 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Kcns1O35173 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Kcns1O35173 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Kcns1O35173 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Kcns1O35173 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Kcns1O35173 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Kcns1O35173 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Kcns1O35173 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Kcns1O35173 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Kcns1O35173 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Kcns1O35173 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Kcns1O35173 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Kcns1O35173 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Kcns1O35173 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Kcns1O35173 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Kcns1O35173 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Kcns1O35173 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Kcns1O35173 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Kcns1O35173 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Kcns1O35173 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Kcns1O35173 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Kcns1O35173 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Kcns1O35173 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Kcns1O35173 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Kcns1O35173 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Kcns1O35173 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Kcns1O35173 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Kcns1O35173 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Kcns1O35173 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Kcns1O35173 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Kcns1O35173 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Kcns1O35173 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Kcns1O35173 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Kcns1O35173 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Kcns1O35173 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Kcns1O35173 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Kcns1O35173 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Kcns1O35173 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Kcns1O35173 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Kcns1O35173 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Kcns1O35173 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Kcns1O35173 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Kcns1O35173 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Kcns1O35173 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Kcns1O35173 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Kcns1O35173 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Kcns1O35173 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Kcns1O35173 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Kcns1O35173 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Kcns1O35173 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Kcns1O35173 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Kcns1O35173 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Kcns1O35173 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Kcns1O35173 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Kcns1O35173 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Kcns1O35173 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Kcns1O35173 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Kcns1O35173 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Kcns1O35173 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Kcns1O35173 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Kcns1O35173 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Kcns1O35173 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Kcns1O35173 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Kcns1O35173 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Kcns1O35173 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Kcns1O35173 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Kcns1O35173 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Kcns1O35173 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Kcns1O35173 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Kcns1O35173 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Kcns1O35173 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Kcns1O35173 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Kcns1O35173 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Kcns1O35173 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Kcns1O35173 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Kcns1O35173 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms