Protein–RNA interactions for Protein: O08795

Prkcsh, Glucosidase 2 subunit beta, mousemouse

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Length 521 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcshO08795 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Gpm6b-208ENSMUST00000112233 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Prkcd-208ENSMUST00000112211 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 AC154352.1-201ENSMUST00000221477 2365 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 AC115891.3-201ENSMUST00000219161 2472 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Gramd1b-213ENSMUST00000211853 2659 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Atg10-201ENSMUST00000022119 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms