Protein–RNA interactions for Protein: O08784

Tcof1, Treacle protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcof1O08784 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcof1O08784 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcof1O08784 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcof1O08784 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcof1O08784 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcof1O08784 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcof1O08784 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcof1O08784 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcof1O08784 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcof1O08784 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcof1O08784 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcof1O08784 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcof1O08784 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcof1O08784 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcof1O08784 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcof1O08784 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcof1O08784 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcof1O08784 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcof1O08784 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcof1O08784 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcof1O08784 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcof1O08784 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcof1O08784 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcof1O08784 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcof1O08784 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcof1O08784 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcof1O08784 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcof1O08784 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcof1O08784 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcof1O08784 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcof1O08784 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcof1O08784 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcof1O08784 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcof1O08784 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcof1O08784 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcof1O08784 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcof1O08784 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcof1O08784 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcof1O08784 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcof1O08784 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcof1O08784 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcof1O08784 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcof1O08784 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcof1O08784 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcof1O08784 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcof1O08784 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcof1O08784 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcof1O08784 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcof1O08784 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcof1O08784 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcof1O08784 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcof1O08784 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcof1O08784 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcof1O08784 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcof1O08784 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcof1O08784 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcof1O08784 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcof1O08784 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcof1O08784 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcof1O08784 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcof1O08784 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcof1O08784 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcof1O08784 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcof1O08784 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcof1O08784 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcof1O08784 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcof1O08784 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcof1O08784 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcof1O08784 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcof1O08784 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcof1O08784 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcof1O08784 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcof1O08784 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcof1O08784 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcof1O08784 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcof1O08784 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcof1O08784 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tcof1O08784 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tcof1O08784 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tcof1O08784 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tcof1O08784 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tcof1O08784 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tcof1O08784 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tcof1O08784 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcof1O08784 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcof1O08784 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcof1O08784 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcof1O08784 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcof1O08784 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcof1O08784 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcof1O08784 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcof1O08784 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcof1O08784 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcof1O08784 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcof1O08784 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcof1O08784 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcof1O08784 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcof1O08784 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcof1O08784 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcof1O08784 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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