Protein–RNA interactions for Protein: M0QW51

Gm17078, Predicted gene 17078, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17078M0QW51 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm17078M0QW51 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm17078M0QW51 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm17078M0QW51 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm17078M0QW51 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm17078M0QW51 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm17078M0QW51 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm17078M0QW51 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm17078M0QW51 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm17078M0QW51 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm17078M0QW51 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm17078M0QW51 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm17078M0QW51 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm17078M0QW51 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm17078M0QW51 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm17078M0QW51 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm17078M0QW51 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm17078M0QW51 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm17078M0QW51 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm17078M0QW51 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm17078M0QW51 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm17078M0QW51 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm17078M0QW51 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm17078M0QW51 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm17078M0QW51 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm17078M0QW51 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm17078M0QW51 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Gm17078M0QW51 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm17078M0QW51 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Gm17078M0QW51 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm17078M0QW51 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm17078M0QW51 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm17078M0QW51 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Gm17078M0QW51 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm17078M0QW51 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm17078M0QW51 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm17078M0QW51 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm17078M0QW51 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm17078M0QW51 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm17078M0QW51 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm17078M0QW51 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm17078M0QW51 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm17078M0QW51 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm17078M0QW51 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm17078M0QW51 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm17078M0QW51 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm17078M0QW51 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm17078M0QW51 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm17078M0QW51 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm17078M0QW51 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm17078M0QW51 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm17078M0QW51 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm17078M0QW51 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm17078M0QW51 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm17078M0QW51 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm17078M0QW51 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm17078M0QW51 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm17078M0QW51 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Gm17078M0QW51 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm17078M0QW51 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm17078M0QW51 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm17078M0QW51 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm17078M0QW51 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm17078M0QW51 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm17078M0QW51 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm17078M0QW51 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm17078M0QW51 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm17078M0QW51 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm17078M0QW51 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm17078M0QW51 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Gm17078M0QW51 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm17078M0QW51 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm17078M0QW51 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm17078M0QW51 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm17078M0QW51 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm17078M0QW51 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm17078M0QW51 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm17078M0QW51 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm17078M0QW51 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm17078M0QW51 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm17078M0QW51 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm17078M0QW51 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm17078M0QW51 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm17078M0QW51 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm17078M0QW51 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm17078M0QW51 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm17078M0QW51 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm17078M0QW51 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm17078M0QW51 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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