Protein–RNA interactions for Protein: L7N248

Gm6871, Predicted gene 6871, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6871L7N248 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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