Protein–RNA interactions for Protein: J3QPC1

Gm933, Predicted gene 933, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm933J3QPC1 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm933J3QPC1 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm933J3QPC1 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm933J3QPC1 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm933J3QPC1 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm933J3QPC1 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm933J3QPC1 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Gm933J3QPC1 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Gm933J3QPC1 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Gm933J3QPC1 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm933J3QPC1 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm933J3QPC1 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm933J3QPC1 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Gm933J3QPC1 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Gm933J3QPC1 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Gm933J3QPC1 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm933J3QPC1 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm933J3QPC1 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm933J3QPC1 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm933J3QPC1 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm933J3QPC1 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm933J3QPC1 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm933J3QPC1 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm933J3QPC1 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm933J3QPC1 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm933J3QPC1 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Gm933J3QPC1 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Gm933J3QPC1 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm933J3QPC1 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Gm933J3QPC1 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Gm933J3QPC1 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm933J3QPC1 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm933J3QPC1 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm933J3QPC1 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm933J3QPC1 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm933J3QPC1 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Gm933J3QPC1 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm933J3QPC1 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm933J3QPC1 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm933J3QPC1 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm933J3QPC1 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm933J3QPC1 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm933J3QPC1 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm933J3QPC1 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm933J3QPC1 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm933J3QPC1 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms