Protein–RNA interactions for Protein: J3QP38

Gm21900, Predicted gene, 21900, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21900J3QP38 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
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Gm21900J3QP38 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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Gm21900J3QP38 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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Gm21900J3QP38 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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Gm21900J3QP38 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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Gm21900J3QP38 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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Gm21900J3QP38 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
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Gm21900J3QP38 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
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