Protein–RNA interactions for Protein: H3BKF4

Gm20708, Predicted gene 20708, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20708H3BKF4 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20708H3BKF4 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20708H3BKF4 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20708H3BKF4 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20708H3BKF4 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20708H3BKF4 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20708H3BKF4 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20708H3BKF4 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20708H3BKF4 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20708H3BKF4 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20708H3BKF4 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20708H3BKF4 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20708H3BKF4 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20708H3BKF4 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20708H3BKF4 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20708H3BKF4 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20708H3BKF4 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20708H3BKF4 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20708H3BKF4 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20708H3BKF4 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20708H3BKF4 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20708H3BKF4 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20708H3BKF4 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20708H3BKF4 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20708H3BKF4 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20708H3BKF4 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20708H3BKF4 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20708H3BKF4 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20708H3BKF4 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20708H3BKF4 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20708H3BKF4 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20708H3BKF4 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20708H3BKF4 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20708H3BKF4 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20708H3BKF4 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20708H3BKF4 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20708H3BKF4 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20708H3BKF4 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20708H3BKF4 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20708H3BKF4 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20708H3BKF4 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20708H3BKF4 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20708H3BKF4 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20708H3BKF4 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20708H3BKF4 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20708H3BKF4 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20708H3BKF4 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20708H3BKF4 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20708H3BKF4 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20708H3BKF4 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20708H3BKF4 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20708H3BKF4 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20708H3BKF4 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20708H3BKF4 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20708H3BKF4 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20708H3BKF4 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20708H3BKF4 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20708H3BKF4 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20708H3BKF4 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20708H3BKF4 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20708H3BKF4 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20708H3BKF4 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20708H3BKF4 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20708H3BKF4 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20708H3BKF4 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20708H3BKF4 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20708H3BKF4 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20708H3BKF4 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20708H3BKF4 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20708H3BKF4 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20708H3BKF4 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20708H3BKF4 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20708H3BKF4 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20708H3BKF4 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20708H3BKF4 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20708H3BKF4 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20708H3BKF4 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20708H3BKF4 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20708H3BKF4 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20708H3BKF4 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20708H3BKF4 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20708H3BKF4 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20708H3BKF4 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20708H3BKF4 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20708H3BKF4 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20708H3BKF4 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20708H3BKF4 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20708H3BKF4 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20708H3BKF4 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20708H3BKF4 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20708H3BKF4 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20708H3BKF4 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20708H3BKF4 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20708H3BKF4 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20708H3BKF4 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20708H3BKF4 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20708H3BKF4 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20708H3BKF4 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20708H3BKF4 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20708H3BKF4 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 453.1 ms