Protein–RNA interactions for Protein: G5E8J6

Hrc, Histidine rich calcium binding protein, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 738 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HrcG5E8J6 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HrcG5E8J6 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HrcG5E8J6 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HrcG5E8J6 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HrcG5E8J6 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HrcG5E8J6 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HrcG5E8J6 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HrcG5E8J6 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HrcG5E8J6 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HrcG5E8J6 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HrcG5E8J6 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HrcG5E8J6 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HrcG5E8J6 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HrcG5E8J6 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HrcG5E8J6 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HrcG5E8J6 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HrcG5E8J6 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HrcG5E8J6 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HrcG5E8J6 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HrcG5E8J6 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HrcG5E8J6 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HrcG5E8J6 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HrcG5E8J6 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HrcG5E8J6 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HrcG5E8J6 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HrcG5E8J6 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HrcG5E8J6 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HrcG5E8J6 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
HrcG5E8J6 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HrcG5E8J6 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HrcG5E8J6 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HrcG5E8J6 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HrcG5E8J6 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HrcG5E8J6 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HrcG5E8J6 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HrcG5E8J6 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HrcG5E8J6 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HrcG5E8J6 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HrcG5E8J6 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HrcG5E8J6 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HrcG5E8J6 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HrcG5E8J6 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HrcG5E8J6 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HrcG5E8J6 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HrcG5E8J6 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HrcG5E8J6 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HrcG5E8J6 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HrcG5E8J6 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HrcG5E8J6 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HrcG5E8J6 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HrcG5E8J6 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HrcG5E8J6 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HrcG5E8J6 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HrcG5E8J6 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HrcG5E8J6 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HrcG5E8J6 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HrcG5E8J6 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HrcG5E8J6 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HrcG5E8J6 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HrcG5E8J6 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HrcG5E8J6 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HrcG5E8J6 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HrcG5E8J6 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HrcG5E8J6 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HrcG5E8J6 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HrcG5E8J6 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HrcG5E8J6 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HrcG5E8J6 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HrcG5E8J6 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HrcG5E8J6 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HrcG5E8J6 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HrcG5E8J6 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HrcG5E8J6 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HrcG5E8J6 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HrcG5E8J6 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HrcG5E8J6 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HrcG5E8J6 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HrcG5E8J6 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HrcG5E8J6 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HrcG5E8J6 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HrcG5E8J6 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HrcG5E8J6 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HrcG5E8J6 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HrcG5E8J6 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HrcG5E8J6 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HrcG5E8J6 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HrcG5E8J6 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HrcG5E8J6 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HrcG5E8J6 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HrcG5E8J6 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HrcG5E8J6 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HrcG5E8J6 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HrcG5E8J6 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HrcG5E8J6 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HrcG5E8J6 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HrcG5E8J6 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HrcG5E8J6 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HrcG5E8J6 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HrcG5E8J6 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HrcG5E8J6 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.7 ms