Protein–RNA interactions for Protein: G3X9F6

Sh3tc1, SH3 domain and tetratricopeptide repeats 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3tc1G3X9F6 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3tc1G3X9F6 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3tc1G3X9F6 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3tc1G3X9F6 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3tc1G3X9F6 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3tc1G3X9F6 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3tc1G3X9F6 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3tc1G3X9F6 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3tc1G3X9F6 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3tc1G3X9F6 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3tc1G3X9F6 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3tc1G3X9F6 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3tc1G3X9F6 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3tc1G3X9F6 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3tc1G3X9F6 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3tc1G3X9F6 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3tc1G3X9F6 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3tc1G3X9F6 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3tc1G3X9F6 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3tc1G3X9F6 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3tc1G3X9F6 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3tc1G3X9F6 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3tc1G3X9F6 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3tc1G3X9F6 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3tc1G3X9F6 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3tc1G3X9F6 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3tc1G3X9F6 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3tc1G3X9F6 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3tc1G3X9F6 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3tc1G3X9F6 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3tc1G3X9F6 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3tc1G3X9F6 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3tc1G3X9F6 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3tc1G3X9F6 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3tc1G3X9F6 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3tc1G3X9F6 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3tc1G3X9F6 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3tc1G3X9F6 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3tc1G3X9F6 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3tc1G3X9F6 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3tc1G3X9F6 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3tc1G3X9F6 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3tc1G3X9F6 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3tc1G3X9F6 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3tc1G3X9F6 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3tc1G3X9F6 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3tc1G3X9F6 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3tc1G3X9F6 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3tc1G3X9F6 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3tc1G3X9F6 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3tc1G3X9F6 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3tc1G3X9F6 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3tc1G3X9F6 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3tc1G3X9F6 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3tc1G3X9F6 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3tc1G3X9F6 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3tc1G3X9F6 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3tc1G3X9F6 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3tc1G3X9F6 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3tc1G3X9F6 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3tc1G3X9F6 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3tc1G3X9F6 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3tc1G3X9F6 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3tc1G3X9F6 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3tc1G3X9F6 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3tc1G3X9F6 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3tc1G3X9F6 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3tc1G3X9F6 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3tc1G3X9F6 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3tc1G3X9F6 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3tc1G3X9F6 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3tc1G3X9F6 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3tc1G3X9F6 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3tc1G3X9F6 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3tc1G3X9F6 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3tc1G3X9F6 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3tc1G3X9F6 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3tc1G3X9F6 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3tc1G3X9F6 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3tc1G3X9F6 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3tc1G3X9F6 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3tc1G3X9F6 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3tc1G3X9F6 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3tc1G3X9F6 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3tc1G3X9F6 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3tc1G3X9F6 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3tc1G3X9F6 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3tc1G3X9F6 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3tc1G3X9F6 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3tc1G3X9F6 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3tc1G3X9F6 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3tc1G3X9F6 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3tc1G3X9F6 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3tc1G3X9F6 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3tc1G3X9F6 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3tc1G3X9F6 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3tc1G3X9F6 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh3tc1G3X9F6 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh3tc1G3X9F6 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh3tc1G3X9F6 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms