Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Gm6562-201ENSMUST00000221903 464 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Gm9519-201ENSMUST00000206108 1337 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Gm28038F7BCN9 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Gm15929-201ENSMUST00000138926 1161 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Gm28038F7BCN9 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Gm28038F7BCN9 Esp36-201ENSMUST00000172814 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Gm28038F7BCN9 Esp36-202ENSMUST00000177882 1117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Gm28038F7BCN9 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Gm28038F7BCN9 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Gm28038F7BCN9 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Gm28038F7BCN9 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Gm28038F7BCN9 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Gm28038F7BCN9 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Gm28038F7BCN9 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Gm28038F7BCN9 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Gm28038F7BCN9 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
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