Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Rac2-201ENSMUST00000043214 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Smyd1-201ENSMUST00000074301 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Acsl5-201ENSMUST00000043150 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Pxmp4-201ENSMUST00000000896 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Phtf1os-201ENSMUST00000160110 4046 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Gm42031-201ENSMUST00000209823 1885 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Ap1m2-202ENSMUST00000115433 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Srcap-201ENSMUST00000066582 4545 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Spty2d1-201ENSMUST00000061639 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Ank1-213ENSMUST00000141784 6566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Olfr429-202ENSMUST00000216346 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Gm28138-201ENSMUST00000186250 2167 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Gm29270-201ENSMUST00000188071 2167 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Gm29392-201ENSMUST00000189429 2167 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Gm29252-201ENSMUST00000189869 2167 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Gm29305-201ENSMUST00000191054 2167 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Klk13-201ENSMUST00000066834 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Sim1-201ENSMUST00000020071 7355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Olfr77-201ENSMUST00000057596 9649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Enah-211ENSMUST00000193703 11229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Ralgps1-205ENSMUST00000131298 6035 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Gm37582-201ENSMUST00000192953 1409 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Tgfbi-201ENSMUST00000045173 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Akap2-202ENSMUST00000098064 7172 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Slc26a1-202ENSMUST00000119270 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Slc26a1-204ENSMUST00000163328 3015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Tsc1-203ENSMUST00000113869 7702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Myo9a-206ENSMUST00000136740 12252 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Kif26b-202ENSMUST00000161017 13749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 BC024978-201ENSMUST00000108379 7247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Kmt2a-201ENSMUST00000002095 16461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Itgam-203ENSMUST00000106242 4649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Adgrl2-217ENSMUST00000200154 5412 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Flnb-201ENSMUST00000052678 9100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Olfr859-203ENSMUST00000217280 9596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Ubr1-201ENSMUST00000028728 7768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Il17ra-201ENSMUST00000002976 7752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Zfp956-201ENSMUST00000101445 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Sdk2-201ENSMUST00000041627 11287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Ccdc141-207ENSMUST00000164114 6222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms