Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms