Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms