Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
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Ccdc71lE9Q4T4 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Ccdc71lE9Q4T4 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
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