Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms