Protein–RNA interactions for Protein: E9PZP8

Herc1, HECT and RLD domain-containing E3 ubiquitin protein ligase family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 4,859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc1E9PZP8 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Nptn-202ENSMUST00000114121 863 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Gm3250-201ENSMUST00000167358 693 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 AC165260.3-201ENSMUST00000225101 665 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 891 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Gm21577-201ENSMUST00000190823 697 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Gm20802-201ENSMUST00000190832 698 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 AC154759.1-201ENSMUST00000224137 1159 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 H2-Bl-203ENSMUST00000183999 358 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Gm6741-201ENSMUST00000057074 1330 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Uqcrc2-201ENSMUST00000033176 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Gm29651-201ENSMUST00000189088 697 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Gm5907-202ENSMUST00000210969 661 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Tmem208-202ENSMUST00000098453 950 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Lemd1-201ENSMUST00000112357 964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Gm43777-201ENSMUST00000197269 376 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Olfr372-201ENSMUST00000093434 1016 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 AC159810.1-201ENSMUST00000214838 1480 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Psca-201ENSMUST00000023265 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Herc1E9PZP8 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
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