Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms