Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms