Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms