Protein–RNA interactions for Protein: E0CXF8

BC035044, cDNA sequence BC035044, mousemouse

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Length 138 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC035044E0CXF8 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
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BC035044E0CXF8 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
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BC035044E0CXF8 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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BC035044E0CXF8 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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BC035044E0CXF8 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
BC035044E0CXF8 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
BC035044E0CXF8 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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