Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70 ms