Protein–RNA interactions for Protein: D3Z0P8

Tmem200b, Transmembrane protein 200B, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200bD3Z0P8 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem200bD3Z0P8 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem200bD3Z0P8 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem200bD3Z0P8 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem200bD3Z0P8 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem200bD3Z0P8 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem200bD3Z0P8 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem200bD3Z0P8 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem200bD3Z0P8 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem200bD3Z0P8 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem200bD3Z0P8 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem200bD3Z0P8 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem200bD3Z0P8 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem200bD3Z0P8 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem200bD3Z0P8 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem200bD3Z0P8 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem200bD3Z0P8 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem200bD3Z0P8 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem200bD3Z0P8 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem200bD3Z0P8 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem200bD3Z0P8 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem200bD3Z0P8 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem200bD3Z0P8 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem200bD3Z0P8 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem200bD3Z0P8 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem200bD3Z0P8 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem200bD3Z0P8 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem200bD3Z0P8 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem200bD3Z0P8 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem200bD3Z0P8 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem200bD3Z0P8 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem200bD3Z0P8 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem200bD3Z0P8 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem200bD3Z0P8 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem200bD3Z0P8 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem200bD3Z0P8 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem200bD3Z0P8 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem200bD3Z0P8 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem200bD3Z0P8 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem200bD3Z0P8 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem200bD3Z0P8 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem200bD3Z0P8 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem200bD3Z0P8 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem200bD3Z0P8 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem200bD3Z0P8 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem200bD3Z0P8 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem200bD3Z0P8 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem200bD3Z0P8 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem200bD3Z0P8 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem200bD3Z0P8 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem200bD3Z0P8 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem200bD3Z0P8 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem200bD3Z0P8 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem200bD3Z0P8 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem200bD3Z0P8 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem200bD3Z0P8 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem200bD3Z0P8 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem200bD3Z0P8 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem200bD3Z0P8 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem200bD3Z0P8 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem200bD3Z0P8 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem200bD3Z0P8 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem200bD3Z0P8 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem200bD3Z0P8 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem200bD3Z0P8 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem200bD3Z0P8 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem200bD3Z0P8 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem200bD3Z0P8 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem200bD3Z0P8 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem200bD3Z0P8 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem200bD3Z0P8 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem200bD3Z0P8 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem200bD3Z0P8 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem200bD3Z0P8 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Tmem200bD3Z0P8 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Tmem200bD3Z0P8 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Tmem200bD3Z0P8 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Tmem200bD3Z0P8 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Tmem200bD3Z0P8 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem200bD3Z0P8 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem200bD3Z0P8 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem200bD3Z0P8 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem200bD3Z0P8 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem200bD3Z0P8 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem200bD3Z0P8 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem200bD3Z0P8 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem200bD3Z0P8 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem200bD3Z0P8 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem200bD3Z0P8 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem200bD3Z0P8 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem200bD3Z0P8 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem200bD3Z0P8 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem200bD3Z0P8 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem200bD3Z0P8 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem200bD3Z0P8 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem200bD3Z0P8 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem200bD3Z0P8 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem200bD3Z0P8 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem200bD3Z0P8 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem200bD3Z0P8 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms