Protein–RNA interactions for Protein: D3YYP3

Gm6685, Predicted pseudogene 6685, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6685D3YYP3 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm6685D3YYP3 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm6685D3YYP3 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm6685D3YYP3 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm6685D3YYP3 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm6685D3YYP3 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm6685D3YYP3 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm6685D3YYP3 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm6685D3YYP3 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm6685D3YYP3 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm6685D3YYP3 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm6685D3YYP3 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm6685D3YYP3 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm6685D3YYP3 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gm6685D3YYP3 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gm6685D3YYP3 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm6685D3YYP3 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm6685D3YYP3 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm6685D3YYP3 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm6685D3YYP3 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm6685D3YYP3 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm6685D3YYP3 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm6685D3YYP3 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm6685D3YYP3 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm6685D3YYP3 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm6685D3YYP3 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm6685D3YYP3 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm6685D3YYP3 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm6685D3YYP3 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm6685D3YYP3 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm6685D3YYP3 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm6685D3YYP3 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm6685D3YYP3 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm6685D3YYP3 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm6685D3YYP3 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm6685D3YYP3 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm6685D3YYP3 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm6685D3YYP3 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm6685D3YYP3 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm6685D3YYP3 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm6685D3YYP3 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm6685D3YYP3 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm6685D3YYP3 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm6685D3YYP3 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm6685D3YYP3 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm6685D3YYP3 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm6685D3YYP3 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm6685D3YYP3 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm6685D3YYP3 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm6685D3YYP3 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6685D3YYP3 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6685D3YYP3 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6685D3YYP3 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6685D3YYP3 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6685D3YYP3 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6685D3YYP3 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6685D3YYP3 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6685D3YYP3 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6685D3YYP3 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6685D3YYP3 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6685D3YYP3 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6685D3YYP3 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6685D3YYP3 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6685D3YYP3 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6685D3YYP3 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6685D3YYP3 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6685D3YYP3 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6685D3YYP3 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6685D3YYP3 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6685D3YYP3 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6685D3YYP3 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6685D3YYP3 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6685D3YYP3 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6685D3YYP3 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6685D3YYP3 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6685D3YYP3 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6685D3YYP3 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6685D3YYP3 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6685D3YYP3 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6685D3YYP3 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6685D3YYP3 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6685D3YYP3 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6685D3YYP3 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6685D3YYP3 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6685D3YYP3 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6685D3YYP3 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6685D3YYP3 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6685D3YYP3 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6685D3YYP3 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6685D3YYP3 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6685D3YYP3 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6685D3YYP3 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6685D3YYP3 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6685D3YYP3 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6685D3YYP3 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6685D3YYP3 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6685D3YYP3 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6685D3YYP3 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm6685D3YYP3 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm6685D3YYP3 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms