Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms