Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms