Protein–RNA interactions for Protein: B2RUS7

Abcc8, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc8B2RUS7 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Abcc8B2RUS7 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Abcc8B2RUS7 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Abcc8B2RUS7 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Abcc8B2RUS7 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Abcc8B2RUS7 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Abcc8B2RUS7 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Abcc8B2RUS7 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Abcc8B2RUS7 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Abcc8B2RUS7 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Abcc8B2RUS7 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Abcc8B2RUS7 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Abcc8B2RUS7 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Abcc8B2RUS7 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Abcc8B2RUS7 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Abcc8B2RUS7 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Abcc8B2RUS7 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Abcc8B2RUS7 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Abcc8B2RUS7 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Abcc8B2RUS7 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Abcc8B2RUS7 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Abcc8B2RUS7 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Abcc8B2RUS7 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Abcc8B2RUS7 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Abcc8B2RUS7 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Abcc8B2RUS7 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Abcc8B2RUS7 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Abcc8B2RUS7 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Abcc8B2RUS7 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Abcc8B2RUS7 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Abcc8B2RUS7 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Abcc8B2RUS7 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Abcc8B2RUS7 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Abcc8B2RUS7 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Abcc8B2RUS7 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Abcc8B2RUS7 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Abcc8B2RUS7 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Abcc8B2RUS7 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Abcc8B2RUS7 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Abcc8B2RUS7 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Abcc8B2RUS7 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Abcc8B2RUS7 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Abcc8B2RUS7 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Abcc8B2RUS7 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Abcc8B2RUS7 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Abcc8B2RUS7 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Abcc8B2RUS7 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Abcc8B2RUS7 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Abcc8B2RUS7 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Abcc8B2RUS7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Abcc8B2RUS7 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Abcc8B2RUS7 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Abcc8B2RUS7 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Abcc8B2RUS7 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Abcc8B2RUS7 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Abcc8B2RUS7 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Abcc8B2RUS7 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Abcc8B2RUS7 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Abcc8B2RUS7 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Abcc8B2RUS7 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Abcc8B2RUS7 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Abcc8B2RUS7 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Abcc8B2RUS7 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Abcc8B2RUS7 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Abcc8B2RUS7 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Abcc8B2RUS7 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Abcc8B2RUS7 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Abcc8B2RUS7 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Abcc8B2RUS7 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Abcc8B2RUS7 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Abcc8B2RUS7 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Abcc8B2RUS7 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Abcc8B2RUS7 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Abcc8B2RUS7 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Abcc8B2RUS7 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Abcc8B2RUS7 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Abcc8B2RUS7 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Abcc8B2RUS7 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Abcc8B2RUS7 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Abcc8B2RUS7 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Abcc8B2RUS7 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Abcc8B2RUS7 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Abcc8B2RUS7 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Abcc8B2RUS7 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Abcc8B2RUS7 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Abcc8B2RUS7 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Abcc8B2RUS7 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Abcc8B2RUS7 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Abcc8B2RUS7 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Abcc8B2RUS7 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Abcc8B2RUS7 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Abcc8B2RUS7 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Abcc8B2RUS7 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Abcc8B2RUS7 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Abcc8B2RUS7 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Abcc8B2RUS7 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Abcc8B2RUS7 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Abcc8B2RUS7 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Abcc8B2RUS7 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Abcc8B2RUS7 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 374.9 ms