Protein–RNA interactions for Protein: B2RUM3

AU015836, AU015836 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU015836B2RUM3 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms