Protein–RNA interactions for Protein: B2RT54

Apol7a, Apolipoprotein L 7a, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7aB2RT54 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Apol7aB2RT54 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Apol7aB2RT54 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Apol7aB2RT54 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Apol7aB2RT54 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Apol7aB2RT54 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Apol7aB2RT54 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Apol7aB2RT54 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Apol7aB2RT54 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Apol7aB2RT54 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Apol7aB2RT54 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Apol7aB2RT54 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Apol7aB2RT54 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apol7aB2RT54 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apol7aB2RT54 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apol7aB2RT54 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apol7aB2RT54 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apol7aB2RT54 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apol7aB2RT54 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apol7aB2RT54 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apol7aB2RT54 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apol7aB2RT54 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apol7aB2RT54 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apol7aB2RT54 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Apol7aB2RT54 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Apol7aB2RT54 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apol7aB2RT54 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apol7aB2RT54 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apol7aB2RT54 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms