Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms