Protein–RNA interactions for Protein: B2RQC2

Usp42, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp42B2RQC2 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp42B2RQC2 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp42B2RQC2 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp42B2RQC2 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp42B2RQC2 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp42B2RQC2 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp42B2RQC2 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp42B2RQC2 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp42B2RQC2 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp42B2RQC2 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp42B2RQC2 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp42B2RQC2 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp42B2RQC2 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp42B2RQC2 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp42B2RQC2 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp42B2RQC2 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp42B2RQC2 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp42B2RQC2 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp42B2RQC2 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Usp42B2RQC2 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Usp42B2RQC2 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Usp42B2RQC2 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Usp42B2RQC2 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Usp42B2RQC2 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Usp42B2RQC2 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Usp42B2RQC2 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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