Protein–RNA interactions for Protein: B1AVK5

Col4a6, Collagen, type IV, alpha 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a6B1AVK5 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Col4a6B1AVK5 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Col4a6B1AVK5 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Col4a6B1AVK5 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Col4a6B1AVK5 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Col4a6B1AVK5 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Col4a6B1AVK5 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Col4a6B1AVK5 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Col4a6B1AVK5 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Col4a6B1AVK5 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Col4a6B1AVK5 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Col4a6B1AVK5 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Col4a6B1AVK5 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Col4a6B1AVK5 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Col4a6B1AVK5 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Col4a6B1AVK5 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Col4a6B1AVK5 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Col4a6B1AVK5 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Col4a6B1AVK5 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Col4a6B1AVK5 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Col4a6B1AVK5 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Col4a6B1AVK5 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Col4a6B1AVK5 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Col4a6B1AVK5 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Col4a6B1AVK5 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Col4a6B1AVK5 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col4a6B1AVK5 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col4a6B1AVK5 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col4a6B1AVK5 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col4a6B1AVK5 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col4a6B1AVK5 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col4a6B1AVK5 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Col4a6B1AVK5 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Col4a6B1AVK5 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col4a6B1AVK5 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col4a6B1AVK5 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col4a6B1AVK5 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Col4a6B1AVK5 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col4a6B1AVK5 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col4a6B1AVK5 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col4a6B1AVK5 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col4a6B1AVK5 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col4a6B1AVK5 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col4a6B1AVK5 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col4a6B1AVK5 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col4a6B1AVK5 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col4a6B1AVK5 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col4a6B1AVK5 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col4a6B1AVK5 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col4a6B1AVK5 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col4a6B1AVK5 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col4a6B1AVK5 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Col4a6B1AVK5 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col4a6B1AVK5 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col4a6B1AVK5 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Col4a6B1AVK5 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Col4a6B1AVK5 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col4a6B1AVK5 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col4a6B1AVK5 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Col4a6B1AVK5 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col4a6B1AVK5 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col4a6B1AVK5 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col4a6B1AVK5 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col4a6B1AVK5 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col4a6B1AVK5 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col4a6B1AVK5 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Col4a6B1AVK5 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col4a6B1AVK5 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col4a6B1AVK5 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col4a6B1AVK5 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col4a6B1AVK5 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col4a6B1AVK5 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col4a6B1AVK5 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col4a6B1AVK5 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col4a6B1AVK5 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col4a6B1AVK5 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col4a6B1AVK5 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col4a6B1AVK5 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col4a6B1AVK5 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col4a6B1AVK5 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col4a6B1AVK5 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col4a6B1AVK5 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col4a6B1AVK5 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col4a6B1AVK5 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col4a6B1AVK5 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col4a6B1AVK5 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col4a6B1AVK5 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col4a6B1AVK5 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col4a6B1AVK5 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col4a6B1AVK5 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col4a6B1AVK5 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col4a6B1AVK5 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col4a6B1AVK5 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col4a6B1AVK5 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col4a6B1AVK5 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col4a6B1AVK5 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col4a6B1AVK5 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col4a6B1AVK5 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col4a6B1AVK5 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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