Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

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Length 919 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Grik3B1AS29 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Grik3B1AS29 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms