Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
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