Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Scn3aA2ASI5 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scn3aA2ASI5 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scn3aA2ASI5 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scn3aA2ASI5 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scn3aA2ASI5 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scn3aA2ASI5 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scn3aA2ASI5 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scn3aA2ASI5 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scn3aA2ASI5 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scn3aA2ASI5 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scn3aA2ASI5 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Scn3aA2ASI5 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scn3aA2ASI5 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scn3aA2ASI5 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scn3aA2ASI5 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scn3aA2ASI5 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Scn3aA2ASI5 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scn3aA2ASI5 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scn3aA2ASI5 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scn3aA2ASI5 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Scn3aA2ASI5 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scn3aA2ASI5 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scn3aA2ASI5 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scn3aA2ASI5 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scn3aA2ASI5 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Scn3aA2ASI5 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scn3aA2ASI5 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scn3aA2ASI5 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scn3aA2ASI5 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scn3aA2ASI5 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scn3aA2ASI5 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scn3aA2ASI5 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Scn3aA2ASI5 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Scn3aA2ASI5 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Scn3aA2ASI5 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Scn3aA2ASI5 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Scn3aA2ASI5 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Scn3aA2ASI5 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Scn3aA2ASI5 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scn3aA2ASI5 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scn3aA2ASI5 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scn3aA2ASI5 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Scn3aA2ASI5 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Scn3aA2ASI5 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scn3aA2ASI5 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scn3aA2ASI5 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Scn3aA2ASI5 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Scn3aA2ASI5 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scn3aA2ASI5 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scn3aA2ASI5 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scn3aA2ASI5 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scn3aA2ASI5 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scn3aA2ASI5 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scn3aA2ASI5 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scn3aA2ASI5 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scn3aA2ASI5 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Scn3aA2ASI5 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scn3aA2ASI5 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Scn3aA2ASI5 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Scn3aA2ASI5 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn3aA2ASI5 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Scn3aA2ASI5 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Scn3aA2ASI5 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Scn3aA2ASI5 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn3aA2ASI5 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn3aA2ASI5 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Scn3aA2ASI5 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn3aA2ASI5 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn3aA2ASI5 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn3aA2ASI5 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn3aA2ASI5 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Scn3aA2ASI5 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn3aA2ASI5 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn3aA2ASI5 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Scn3aA2ASI5 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Scn3aA2ASI5 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Scn3aA2ASI5 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn3aA2ASI5 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn3aA2ASI5 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Scn3aA2ASI5 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn3aA2ASI5 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn3aA2ASI5 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn3aA2ASI5 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Scn3aA2ASI5 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Scn3aA2ASI5 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Scn3aA2ASI5 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn3aA2ASI5 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Scn3aA2ASI5 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn3aA2ASI5 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn3aA2ASI5 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Scn3aA2ASI5 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn3aA2ASI5 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Scn3aA2ASI5 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Scn3aA2ASI5 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn3aA2ASI5 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Scn3aA2ASI5 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn3aA2ASI5 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn3aA2ASI5 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn3aA2ASI5 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms