Protein–RNA interactions for Protein: A2AGT5

Ckap5, Cytoskeleton-associated protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap5A2AGT5 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Ckap5A2AGT5 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ckap5A2AGT5 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ckap5A2AGT5 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ckap5A2AGT5 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ckap5A2AGT5 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ckap5A2AGT5 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ckap5A2AGT5 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ckap5A2AGT5 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ckap5A2AGT5 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ckap5A2AGT5 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ckap5A2AGT5 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ckap5A2AGT5 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ckap5A2AGT5 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ckap5A2AGT5 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ckap5A2AGT5 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ckap5A2AGT5 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ckap5A2AGT5 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ckap5A2AGT5 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ckap5A2AGT5 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ckap5A2AGT5 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ckap5A2AGT5 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ckap5A2AGT5 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ckap5A2AGT5 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ckap5A2AGT5 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ckap5A2AGT5 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ckap5A2AGT5 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ckap5A2AGT5 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ckap5A2AGT5 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ckap5A2AGT5 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ckap5A2AGT5 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ckap5A2AGT5 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ckap5A2AGT5 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ckap5A2AGT5 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ckap5A2AGT5 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ckap5A2AGT5 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ckap5A2AGT5 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ckap5A2AGT5 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ckap5A2AGT5 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ckap5A2AGT5 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ckap5A2AGT5 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ckap5A2AGT5 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ckap5A2AGT5 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ckap5A2AGT5 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ckap5A2AGT5 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ckap5A2AGT5 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ckap5A2AGT5 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ckap5A2AGT5 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ckap5A2AGT5 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ckap5A2AGT5 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ckap5A2AGT5 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ckap5A2AGT5 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ckap5A2AGT5 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ckap5A2AGT5 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ckap5A2AGT5 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ckap5A2AGT5 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ckap5A2AGT5 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ckap5A2AGT5 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ckap5A2AGT5 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ckap5A2AGT5 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ckap5A2AGT5 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ckap5A2AGT5 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ckap5A2AGT5 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ckap5A2AGT5 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ckap5A2AGT5 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ckap5A2AGT5 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ckap5A2AGT5 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ckap5A2AGT5 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ckap5A2AGT5 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ckap5A2AGT5 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ckap5A2AGT5 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ckap5A2AGT5 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ckap5A2AGT5 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ckap5A2AGT5 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ckap5A2AGT5 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ckap5A2AGT5 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ckap5A2AGT5 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ckap5A2AGT5 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ckap5A2AGT5 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ckap5A2AGT5 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ckap5A2AGT5 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ckap5A2AGT5 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ckap5A2AGT5 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ckap5A2AGT5 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ckap5A2AGT5 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ckap5A2AGT5 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ckap5A2AGT5 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ckap5A2AGT5 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ckap5A2AGT5 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ckap5A2AGT5 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ckap5A2AGT5 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ckap5A2AGT5 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ckap5A2AGT5 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ckap5A2AGT5 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ckap5A2AGT5 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ckap5A2AGT5 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ckap5A2AGT5 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ckap5A2AGT5 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ckap5A2AGT5 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ckap5A2AGT5 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms