Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Pramef6A2A8M8 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Pramef6A2A8M8 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Pramef6A2A8M8 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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