Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms