Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms