Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms