Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0H8

Clip2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip2Q9Z0H8 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Clip2Q9Z0H8 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Clip2Q9Z0H8 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Clip2Q9Z0H8 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Clip2Q9Z0H8 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Clip2Q9Z0H8 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Clip2Q9Z0H8 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Clip2Q9Z0H8 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Clip2Q9Z0H8 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Clip2Q9Z0H8 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Clip2Q9Z0H8 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Clip2Q9Z0H8 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Clip2Q9Z0H8 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
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Clip2Q9Z0H8 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms