Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

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Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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