Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms