Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms