Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLH8

Tmod4, Tropomodulin-4, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod4Q9JLH8 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Tmod4Q9JLH8 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmod4Q9JLH8 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmod4Q9JLH8 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmod4Q9JLH8 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmod4Q9JLH8 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Tmod4Q9JLH8 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmod4Q9JLH8 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmod4Q9JLH8 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmod4Q9JLH8 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmod4Q9JLH8 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmod4Q9JLH8 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmod4Q9JLH8 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmod4Q9JLH8 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Tmod4Q9JLH8 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmod4Q9JLH8 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmod4Q9JLH8 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmod4Q9JLH8 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmod4Q9JLH8 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmod4Q9JLH8 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmod4Q9JLH8 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmod4Q9JLH8 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmod4Q9JLH8 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmod4Q9JLH8 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmod4Q9JLH8 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmod4Q9JLH8 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Tmod4Q9JLH8 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmod4Q9JLH8 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmod4Q9JLH8 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmod4Q9JLH8 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmod4Q9JLH8 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmod4Q9JLH8 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmod4Q9JLH8 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmod4Q9JLH8 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmod4Q9JLH8 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmod4Q9JLH8 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmod4Q9JLH8 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmod4Q9JLH8 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmod4Q9JLH8 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Tmod4Q9JLH8 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmod4Q9JLH8 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmod4Q9JLH8 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmod4Q9JLH8 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmod4Q9JLH8 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Tmod4Q9JLH8 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmod4Q9JLH8 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmod4Q9JLH8 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmod4Q9JLH8 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmod4Q9JLH8 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Tmod4Q9JLH8 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmod4Q9JLH8 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmod4Q9JLH8 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmod4Q9JLH8 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmod4Q9JLH8 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Tmod4Q9JLH8 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmod4Q9JLH8 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmod4Q9JLH8 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmod4Q9JLH8 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmod4Q9JLH8 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmod4Q9JLH8 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmod4Q9JLH8 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmod4Q9JLH8 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmod4Q9JLH8 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Tmod4Q9JLH8 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmod4Q9JLH8 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmod4Q9JLH8 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Tmod4Q9JLH8 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmod4Q9JLH8 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmod4Q9JLH8 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmod4Q9JLH8 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmod4Q9JLH8 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmod4Q9JLH8 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmod4Q9JLH8 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmod4Q9JLH8 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmod4Q9JLH8 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmod4Q9JLH8 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmod4Q9JLH8 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmod4Q9JLH8 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Tmod4Q9JLH8 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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