Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL70

Fanca, Fanconi anemia group A protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FancaQ9JL70 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FancaQ9JL70 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FancaQ9JL70 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FancaQ9JL70 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FancaQ9JL70 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FancaQ9JL70 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FancaQ9JL70 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
FancaQ9JL70 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FancaQ9JL70 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FancaQ9JL70 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
FancaQ9JL70 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FancaQ9JL70 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FancaQ9JL70 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FancaQ9JL70 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FancaQ9JL70 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FancaQ9JL70 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FancaQ9JL70 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FancaQ9JL70 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FancaQ9JL70 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FancaQ9JL70 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
FancaQ9JL70 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FancaQ9JL70 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FancaQ9JL70 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FancaQ9JL70 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FancaQ9JL70 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FancaQ9JL70 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FancaQ9JL70 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FancaQ9JL70 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FancaQ9JL70 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
FancaQ9JL70 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
FancaQ9JL70 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FancaQ9JL70 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
FancaQ9JL70 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FancaQ9JL70 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FancaQ9JL70 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FancaQ9JL70 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
FancaQ9JL70 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FancaQ9JL70 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FancaQ9JL70 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FancaQ9JL70 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FancaQ9JL70 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FancaQ9JL70 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FancaQ9JL70 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
FancaQ9JL70 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FancaQ9JL70 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FancaQ9JL70 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FancaQ9JL70 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FancaQ9JL70 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FancaQ9JL70 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FancaQ9JL70 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FancaQ9JL70 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FancaQ9JL70 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FancaQ9JL70 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FancaQ9JL70 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FancaQ9JL70 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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FancaQ9JL70 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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FancaQ9JL70 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FancaQ9JL70 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FancaQ9JL70 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FancaQ9JL70 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FancaQ9JL70 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FancaQ9JL70 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
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FancaQ9JL70 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FancaQ9JL70 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FancaQ9JL70 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FancaQ9JL70 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FancaQ9JL70 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FancaQ9JL70 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FancaQ9JL70 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FancaQ9JL70 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FancaQ9JL70 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FancaQ9JL70 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FancaQ9JL70 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FancaQ9JL70 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FancaQ9JL70 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
FancaQ9JL70 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FancaQ9JL70 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
FancaQ9JL70 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
FancaQ9JL70 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
FancaQ9JL70 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FancaQ9JL70 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FancaQ9JL70 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
FancaQ9JL70 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FancaQ9JL70 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FancaQ9JL70 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FancaQ9JL70 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FancaQ9JL70 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FancaQ9JL70 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FancaQ9JL70 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FancaQ9JL70 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FancaQ9JL70 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FancaQ9JL70 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms